Videoprehliadka
Pozrite si videoprehliadku nášho Laboratória prietokovej cytometrie, fenotypizácie buniek a tkanivového inžinierstva
Výskumná činnosť nášho laboratória je zameraná na optimalizáciu prípravy unikátnych in vitro modelov (3D a 2D nádorových bunkových línií), odvodených z ľudského nádorového tkaniva. Vedeckí pracovníci laboratória disponujú niekoľkoročnými skúsenosťami s technológiou prípravy takýchto modelov z rôznych typov nádorových ochorení (duktálny adenokarcinóm pankreasu, kolorektálny karcinóm a neuroendokrinné nádory). Novovyvinuté nádorové línie následne charakterizujeme na úrovni in vitro (prietokovou cytometriou, fluorescenčnou mikroskopiou, proteínovými čipmi, Western blotom a PCR metódou) a in vivo, xenotransplantáciou ľudských nádorových buniek do atymických myšacích modelov línie Crl:NU(NCr)-Foxn1nu, za účelom zistenia histologickej podobnosti xenograftu a pôvodného nádorového tkaniva. V spolupráci s Ústavom živočísnej fyziológie a genetiky AV ČR v Liběchově, ČR a využitím veľkého živočíšneho modelu a našich bunkových línií práve prebieha projekt XenoPig, ktorý umožní modelovanie nádorových ochorení na modeli, ktorý je fyziologicky bližší človeku.
Uvedené technológie sú pokračovaním prvej úspešnej izolácie 3D nádorovej línie (3DiNET) z neuroendokrinného nádoru pankresu. Nezávislé testovanie tejto línie, pripravenej pracovníkom nášho laboratória práve prebieha v laboratóriách Harvard Medical School v Bostone. Prípravou unikátnych in vitro a in vivo modelov chceme prispieť k celosvetovému úsiliu v boji proti nádorovým ochoreniam.
Naše laboratórium sa ako jedno z prvých na Slovensku etablovalo aj v technológii prípravy indukovaných pluripotentných kmeňových buniek (iPSc). Naše takmer 12-ročné skúsenosti s technológiou využívame v rámci riešenia projektu APVV a medzinárodnej spolupráce na prípravu in vitro modelov pre výskum amyotrofickej laterálnej sklerózy (ALS) a iných neurodegeneratívnych ochorení. Nami optimalizovaná technológia umožňuje prípravu prakticky nekonečného množstva ťažko dostupných typov buniek, potrebných na výskum ochorenia – v prípade ALS sú to motorické neuróny, ktorých získanie z ALS pacientov je prakticky nemožné z dôvodu veľkej invazivity.
V našom laboratóriu bola pripravená a plne charakterizovaná bunková línia, odvodená z indukovaných pluripotentných kmeňových buniek, ktorá je historicky prvou slovenskou bunkovou líniou registrovanou v hPSC registri Charité Universitatsmedizin Berlin (https://hpscreg.eu/cell-line/ORIONi001-A).
Okrem výskumných aktivít sú všetci členovia laboratória od začiatku zapojení do boja proti pandémii koronavírusu SARS-CoV-2.
Pozrite si videoprehliadku nášho Laboratória prietokovej cytometrie, fenotypizácie buniek a tkanivového inžinierstva
V laboratóriu sa nachádzajú viaceré sofistikované prístroje napr. prietokový cytometer/sorter FACS ARIA II, fluorescenčný mikroskop Olympus iX72, svetelný mikroskop, laminárne boxy triedy BSL-2, bunkové inkubátory, PCR termocyklery a elektroforetické aparatúry na Western blot a PCR.
Naše laboratórium ponúka možnosť zaškolenia do prietokovej cytometrie, metódy MACS (magnetického sortingu), imunohistochémie, imunofluorescenčnej cytochémie, antibody array proteínových čipov, western blotovej analýzy expresie proteínov a prípravy primárnych bunkových línií z nádorov alebo kmeňových buniek z kožných biopsií pacientov. V rámci vedeckej spolupráce ponúkame aj praktické zaškolenie do in vivo metódy xenotransplantácie buniek. Ponúkame tiež poradenstvo v procese patentovania v oblasti biotechnológií.
Predstavujeme vám virtuálnu prehliadku nášho moderného Laboratória prietokovej cytometrie, fenotypizácie buniek a tkanivového inžinierstva
APVV-21-0372: Vyvinutie veľkého ortotopického xenotransplantačného živočíšneho modelu (XenoPig) pre modelovanie rakoviny pankreasu.
(Zodp. riešiteľ: Ing. Ján Strnádel, PhD.)
APVV-17-0037: Vývoj nových in vitro modelov pre amyotrofickú laterálnu sklerózu a testovanie bezpečnosti neurálnych prekurzorov odvodených z ľudských indukovaných pluripotentných kmeňových buniek.
(Zodp. riešiteľ: Ing. Ján Strnádel, PhD.)
VEGA 1/0046/25: Štúdium mechanizmu spontánnej regresie malígneho melanómu na unikátnom živočíšnom modeli.
(Zodp. riešiteľ: Ing. Ján Strnádel, PhD.)
VEGA 1/0145/22: Úloha nekódujucich RNA pri vzniku a rozvoji veľkej depresívnej poruchy.
(Zodp. riešiteľ RNDr. Dušan Braný, PhD.)
VEGA 1/0279/18: Využitie novovyvinutých 3D nádorových in vitro modelov pri testovaní aktivovaných nanočastíc inhibujúcich opravné mechanizmy DNA.
(Zodp. riešiteľ: Ing. Ján Strnádel, PhD.)
Strnadel J, Valasek MA, Lin GY, Lin H, Tipps AMP, Woo SM, Fujimura K, Wang H, Choi S, Bui J, Hermosillo C, Jepsen K, Navarro MR, Kelber JA, Klemke RL, Bouvet M. Development of 3D-iNET ORION: a novel, pre-clinical, three-dimensional in vitro cell model for modeling human metastatic neuroendocrine tumor of the pancreas. Hum Cell. 2024;37(5):1593-1601. doi: 10.1007/s13577-024-01113-7
Hajduchova D, Suroviakova S, Mersakova S, Brany D, Zahumenska R, Rehak M, Skovierova H, Nováková S, Nosal V, Marcinek J, Kalman M, Jozef Pec M, Brozmanova M, Melegova J, Juhas S, Juhasova J, Studenovska H, Mitruskova B, Pokusa M, Samec M, Samos M, Nicodemou A, Danisovic L, Dankova Z, Kurca E, Lexova Kolejakova K, Chandoga J, Plank L, Halasova E, Pecova R, Strnadel J. Modelling Duchenne muscular dystrophy in vitro with newly generated, blood cell-derived induced pluripotent stem cell line ORIONi003-A. Stem Cell Res. 2023;71:103187. doi: 10.1016/j.scr.2023.103187
Zahumenska R, Kalman M, Marcinek J, Mersakova S, Kertys M, Pindura M, Palkoci B, Kycina R, Vojtko M, Chromec T, Dumortier HM, Skovierova H, Novakova S, Mitruskova B, Kapralik I, Loderer D, Grendar M, Brany D, Mokry J, Bouvet M, Valasek MA, Janik J, Plank L, Laca L, Halasova E, Strnadel J. Establishment of PANDA – a new human pancreatic ductal adenocarcinoma cell line with 3D cell culture technology. Neoplasma. 2022;69(1):165-173. doi: 10.4149/neo_2021_210924N1360
Strnadel J, Dumortier HM, Hajduchova D, Zahumenska R, Nosal V, Smolar M, Marcinek J, Kalman M, Mersakova S, Brany D, Juhas S, Juhasova J, Studenovska H, Mitruskova B, Suroviakova S, Novakova S, Skovierova H, Kurca E, Pecova R, Plank L, Halasova E. In vitro modeling of amyotrophic lateral sclerosis with induced pluripotent stem cell technology-derived cell line ORIONi002-A. Stem Cell Res. 2022;63:102870. doi: 10.1016/j.scr.2022.102870
Mersakova S, Janikova K, Kalman M, Marcinek J, Grendar M, Vojtko M, Kycina R, Pindura M, Janik J, Mikolajcik P, Gabonova E, Laca L, Mejstrikova E, Halasova E, Strnadel J, Lasabova Z. Cancer stem cell marker expression and methylation status in patients with colorectal cancer. Oncol Lett. 2022;24(1):231. doi: 10.3892/ol.2022.13352
Kertys M, Grendar M, Horak V, Zidekova N, Kupcova Skalnikova H, Mokry J, Halasova E, Strnadel J. Metabolomic characterisation of progression and spontaneous regression of melanoma in the melanoma-bearing Libechov minipig model. Melanoma Res. 2021;31(2):140-151. doi: 10.1097/CMR.0000000000000722
Melo CM, Wang H, Fujimura K, Strnadel J, Meneghetti MCZ, Nader HB, Klemke RL, Pinhal MAS. The Heparan Sulfate Binding Peptide in Tumor Progression of Triple-Negative Breast Cancer. Front Oncol. 2021;11:697626. doi: 10.3389/fonc.2021.697626
Meršaková S, Lasabová Z, Strnádel J, Kalman M, Gabonova E, Sabaka P, Ciccocioppo R, Rodrigo L, Kruzliak P, Mikolajčík P. Genomic profile and immune contexture in colorectal cancer-relevance for prognosis and immunotherapy. Clin Exp Med. 2021;21(2):195-204. doi: 10.1007/s10238-020-00649-w
Strnadel J, Zahumenska R, Nosal V, Smolar M, Marcinek J, Kalman M, Juhas S, Juhasova J, Studenovska H, Dumortier H, Chromec T, Skovierova H, Mitruskova B, Kapralik I, Mersakova S, Brany D, Halasova E. Generation of ORIONi001-A induced pluripotent stem cell line for in vitro modeling of sporadic form of amyotrophic lateral sclerosis. Stem Cell Res. 2020;48:101981. doi: 10.1016/j.scr.2020.101981
Výsledkom projektu BioMed Martin, financovaného z EÚ, je prevratné výskumné centrum, ktoré vyvíja nové diagnostické a terapeutické metódy a súčasne posilňuje spoluprácu medzi mestom Martin a Žilinským krajom na Slovensku.