Videoprehliadka
Prezrite si videoprehliadku nášho laboratória metabolomiky.
Menu
Laboratórium metabolomiky je unikátnym pracoviskom, ktoré na jednom mieste umožňuje ucelené sledovanie metabolických procesov a charakterizáciu látok, v kombinácii s neinvazívnym zobrazovaním.
Metabolizmus buniek je základným znakom života a jeho následkom vznikajú v živom organizme metabolity. Analýza zmien ich koncentrácie predstavuje jeden zo základných diagnostických nástrojov súčasnej medicíny. Laboratórium metabolomiky ponúka cielenú a necielenú metabolomickú analýzu pomocou vysokošpecializovaných prístrojov, vrátane hmotnostného spektrometra (s presnosťou 0,0001 Da) a 600 MHz NMR spektrometra. Zameriavame sa najmä na metabolické analýzy nízkomolekulových látok v tkanivách, bunkových kultúrach a biologických tekutinách (krvná plazma, moč, likvor, extrakty tkanív, bunkové média a lyzáty).
Laboratórium disponuje aj experimentálnym 7 Teslovým skenerom na báze magnetickej rezonancie, pomocou ktorého dokážeme neinvazívne zobrazovať (MRI) nielen biologické systémy, ale aj iné typy vzoriek. Zobrazovacie sekvencie umožňujú sledovanie širokej škály in vivo, ex vivo a in vitro procesov, a preto sú vhodné aj na monitorovanie funkcionalizovanej terapie pomocou magnetických nanočastíc (teranostika). Navyše, využitím spektroskopických metód (MRS), vieme sledovať biochemické profily skúmaných tkanív, vrátane dynamických farmakologických a metabolických dejov in vivo.
Prezrite si videoprehliadku nášho laboratória metabolomiky.
NMR spektrometer Bruker Avance III 600 MHz
MRI/MRS skener Bruker BioSpec 70/20 USR 7 T
Zariadenie na anestéziu RWD s inhalačnou látkou izoflurán
Vysoko-rozlišovací hmotnostný spektrometer Bruker Q-TOF
Predstavujeme vám virtuálnu prehliadku nášho moderného laboratória metabolomiky.
Riešené projekty
Najvýznamnejšie publikácie
Antal I, Strbak O, Khmara I, Koneracka M, Kubovcikova M, Zavisova V, Kmetova M, Baranovicova E, and Dobrota D. MRI relaxivity changes of the magnetic nanoparticles induced by different amino acid coatings. Nanomaterials2020, 10:394. doi:10.3390/nano10020394
https://www.mdpi.com/2079-4991/10/2/394
Baranovicova E, Kalenska D, Tomascova A, Holubcikova S, Lehotsky J. Time-related metabolomics study in the rat plasma after global cerebral ischemia and reperfusion: Effect of ischemic preconditioning. IUBMB Life 2020, 72:2010-2023. doi: 10.1002/iub.2340
https://iubmb.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/iub.2340
Hnilicova, P., Strbak, O., Kolisek, M., Kurca, E., Zelenak, K., Sivak, S., Kantorova, E. Current methods of magnetic resonance for noninvasive assessment of molecular aspects of pathoetiology in Muliple Sclerosis. Int J Mol Sci2020, 21:6117. doi: 10.3390/ijms21176117
https://www.mdpi.com/1422-0067/21/17/6117
Kovalska M, Hnilicova P, Kalenska D, Tomascova A, Adamkov M, Lehotsky J: Effect of Methionine Diet on Time-Related Metabolic and Histopathological Changes of Rat Hippocampus in the Model of Global Brain Ischemia. Biomolecules 2020, 10:1-20. doi: 10.3390/biom10081128
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7465067/
Strbak O, Antal I, Khmara I, Koneracka M, Kubovcikova M, Zavisova V, Molcan M, Jurikova A, Hnilicova P, Gombos J, Kadasova N, Dobrota D. Influence of dextran molecular weight on the physical properties of magnetic nanoparticles for hyperthermia and MRI applications. Nanomaterials 2020, 10:2468. doi:10.3390/nano10122468
https://www.mdpi.com/2079-4991/10/12/2468
Strbak O, Balejcikova L, Kmetova M, Gombos J, Trancikova A, Pokusa M, Kopcansky P. Quantification of iron release from native ferritin and magnetoferritin induced by vitamins B2 and C. Int J Mol Sci 2020, 21:6332. doi:10.3390/ijms21176332
https://www.mdpi.com/1422-0067/21/17/6332
Baranovicova E, Galanda T, Galanda M, Hatok J, Kolarovszki B, Richterova R, Racay P. Metabolomic profiling of blood plasma in patients with primary brain tumours: Basal plasma metabolites correlated with tumour grade and plasma biomarker analysis predicts feasibility of the successful statistical discrimination from healthy subjects – a preliminary study. IUBMB Life 2019, 71:1994-2002. doi: 10.1002/iub.2149
https://iubmb.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/iub.2149
Hnilicova P, Kantorova E, Polacek H, Grendar M, Bittsansky M, Cierny D, Sivak S, Zelenak K, Lehotsky J, Dobrota D, Kurca E. Altered hypothalamic metabolism in early multiple sclerosis – MS spectroscopy study. J Neurol Sci2019, 407:1-9. doi: 10.1016/j.jns.2019.116458
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31622679
Baranovicova E, Kalenska D, Tomascova A, Lehotsky J. Metabolomic study of altered energy metabolism during global forebrain ischemia and ischemic precoditioning in blood plasma in homocysteine treated rats. J Physiol Pharmacol 2018, 69:901-909. doi: 10.26402/jpp.2018.6.04
http://www.jpp.krakow.pl/journal/archive/12_18/pdf/10.26402/jpp.2018.6.04.pdf
Hnilicova P, Povazan M, Strasser B, Andronesi OC, Gajdosik M, Dydak U, Ukropec J, Dobrota D, Trattnig S, Bogner W: Spatial variability and reproducibility of GABA-edited MEGA-LASER 3D- MRSI in the brain at 3T. NMR in Biomedicine 2016, 29(11):1656-1665. doi: 10.1002/nbm.3613
Výsledkom projektu BioMed Martin, financovaného z EÚ, je prevratné výskumné centrum, ktoré vyvíja nové diagnostické a terapeutické metódy a súčasne posilňuje spoluprácu medzi mestom Martin a Žilinským krajom na Slovensku.