Videoprehliadka
Prezrite si videoprehliadku nášho laboratória metabolomiky.
Laboratórium metabolomiky ponúka cielenú a necielenú metabolomickú analýzu pomocou vysokošpecializovaných prístrojov, vrátane kombinácie kvapalinového chromatografu s hmotnostným spektrometrom (s presnosťou 0,0001 Da) a 600 MHz NMR spektrometra.
Metabolizmus buniek je základným znakom života a jeho následkom vznikajú v živom organizme metabolity. Analýza zmien ich koncentrácie predstavuje jeden zo základných diagnostických nástrojov súčasnej medicíny. Laboratórium metabolomiky ponúka cielenú a necielenú metabolomickú analýzu pomocou vysokošpecializovaných prístrojov, vrátane hmotnostného spektrometra (s presnosťou 0,0001 Da) a 600 MHz NMR spektrometra. Zameriavame sa najmä na metabolické analýzy nízkomolekulových látok v tkanivách, bunkových kultúrach a biologických tekutinách (krvná plazma, moč, likvor, extrakty tkanív, bunkové média a lyzáty).
Laboratórium disponuje aj experimentálnym 7 Teslovým skenerom na báze magnetickej rezonancie, pomocou ktorého dokážeme neinvazívne zobrazovať (MRI) nielen biologické systémy, ale aj iné typy vzoriek. Zobrazovacie sekvencie umožňujú sledovanie širokej škály in vivo, ex vivo a in vitro procesov, a preto sú vhodné aj na monitorovanie funkcionalizovanej terapie pomocou magnetických nanočastíc (teranostika). Navyše, využitím spektroskopických metód (MRS), vieme sledovať biochemické profily skúmaných tkanív, vrátane dynamických farmakologických a metabolických dejov in vivo.
Prezrite si videoprehliadku nášho laboratória metabolomiky.
NMR spektrometer Bruker Avance III 600 MHz
MRI/MRS skener Bruker BioSpec 70/20 USR 7 T
Zariadenie na anestéziu RWD s inhalačnou látkou izoflurán
Kombinácia kvapalinového chromatografu Agilent s vysoko-rozlišovacím hmotnostným spektrometrom Bruker Q-TOF
Predstavujeme vám virtuálnu prehliadku nášho moderného laboratória metabolomiky.
Riešené projekty
TEF-Health: Testing and Experimentation Facility for Health – Advanced diagnostics of neurodegenerative disorders using magnetic resonance techniques and artificial intelligence
(Zodp. riešiteľ: RNDr. Oliver Štrbák, PhD.)
COST – CA 21115: Iron-sulphur (FeS) clusters: from chemistry to immunology.
Člen riadiaceho výboru: RNDr. Oliver Štrbák, PhD. (2022-2026)
COST – CA17115: European network for advancing electromagnetic hyperthermic medical technologies. (Laboratórium figuruje ako člen predsedníctva, v spolupráci s Universita Ta Malta).
R3 projekt: Zápal, deficit tvorby FeS klastrov a akumulácia železa ako predvoj vzniku neurodegenerácie.
(Zodp. riešiteľ: RNDr. Oliver Štrbák, PhD.)
APVV-22-0122: Pokročilá diagnostika neurodegeneratívnych ochorení pomocou techník magnetickej rezonancie a umelej inteligencie.
(Zodp. riešiteľ: RNDr. Oliver Štrbák, PhD.)
MZ SR 2018/11-UKMT-7: Mapovanie biogénnych oxidov železa ako biomarkerov neurodegeneratívnych chorôb pomocou pokročilých metód magnetickej rezonancie.
(Zodp. riešiteľ: RNDr. Oliver Štrbák, PhD.)
VEGA 1/0092/22: Využitie nadštandardných rádiologických, proteomických a genetických analýz pri diferenciálnej diagnostike progresívnych foriem sklerózy multiplex
(Zodp. riešiteľka: Ing. Petra Hnilicová, PhD., doc. MUDr. Ema Kantorová, PhD.)
APVV-SK-AT-20-0010: Multiparametrické vyšetrenia Miyoshiho myopatie pomocou modalít magnetickej rezonancie.
(Zodp. riešiteľka: Ing. Petra Hnilicová, PhD.)
SPOLURIEŠITEĽSKÉ PROJEKTY:
APVV-15-0107: Úloha vitamínu D a ďalších markerov vo vzťahu k priebehu sclerosis multiplex.
(Zodp. riešiteľ: prof. RNDr. Ján Lehotský, Dr.Sc.)
APVV-18-0088: Kompletná molekulová charakterizácia heterogenity a signalizácie gliálnych buniek v procese. tumorigenézy.
(Zodp. riešiteľ: doc. RNDr. Jozef Hatok, PhD.)
VEGA 2/0049/23: Funkcionalizované magnetické nanočastice pre MRI zobrazovanie distribúcie liečiva v pľúcach pri experimentálnom syndróme akútnej respiračnej tiesne (ARDS).
(Zodp. riešiteľka: Ing. Martina Koneracká, CSc.) V spolupráci s Ústavom experimentálnej biofyziky SAV.
VEGA 1/0230/20: Úloha cholekalciferolu a jeho metabolitov v rozvoji EAE a sclerosis multiplex: Translačné molekulárne a proteomické štúdium. UK).
(Zodp. riešiteľ: prof. RNDr. Ján Lehotský, Dr.Sc.)
VEGA 1/0173/20: Železo a iné prvky v CNS ako markery expozície elektromagnetickým poliam.
(Zodp. riešiteľ: Ing. Jakub Míšek, PhD.)
VEGA 1/0301/19: Hodnotenie kognitívnych porúch pri sclerosis multiplex a ich vzťah ku genetickým a rádiologickým markerom ochorenia.
(Zodp. riešiteľka: doc. MUDr. Ema Kantorová, PhD.)
Najvýznamnejšie publikácie
Baranovicova E, Vnucak M, Granak K, Kleinova P, Halasova E, Dedinska I.Assessment of metabolites in urine in post-kidney transplant patients: insights into allograft function and creatinine clearance. Metabolomics 2025; 21(2): 44. doi: 10.1007/s11306-025-02246-y
Baranovicova E, Kalenska D, Lehotsky J.Glutamate/GABA/glutamine ratios in intact and ischemia reperfusion challenged rat brain subregions, the effect of ischemic preconditioning. Metab. Brain Dis. 2025; 40(2): 121. doi: 10.1007/s11011-024-01511-8.
Krafcik A, Frollo I, Strbak O, Babinec P. Finite element modeling of the rotational dynamics of a single magnetic particle in a strong magnetic field and liquid medium. Mod. Phys. Lett. B 2024; 38(26): 2450237. doi: 10.1142/S0217984924502373
Baranovicova E, Kalenska D, Kaplan P, Kovalska M, Tatarkova Z, Lehotsky J.Blood and Brain Metabolites after Cerebral Ischemia. Int. J. Mol. Sci. 2023; 24(24): 17302. doi: 10.3390/ijms242417302
Kopcansky P, Balejcikova L, Molcan M, Strbak O, Safarik I, Baldikova E, Prochazkova J, Angelova R, Pospiskova K, Rajnak M, Paulovicova K, Karpets M, Timko M, Tomasovicova N, Zakutanska K, Lackova V, Bury P. Magnetic nanoparticles change the properties of traditional materials and open up new application possibilities. In Materials aspects of ferrofluids, ISBN 978-1-032-22798-6, Boca Raton: CRC Press, 2023, p. 214-249
Kubovcikova M, Sobotova R, Zavisova V, Antal I, Khmara I, Lisnichuk M, Bednarikova Z, Jurikova A, Strbak O, Vojtova J, Mikolka P, Gombos J, Lokajova A, Gazova Z, Koneracka M. N-acetycysteine-loaded magnetic nanoparticles for magnetic resonance imaging. Int. J. Mol. Sci. 2023; 24: 11414. doi: 10.3390/ijms241411414
Antal I, Strbak O, Zavisova V, Vojtova J, Kubovcikova M, Jurikova A, Khmara I, Girman V, Dzunda R, Koval K, Koneracka M. Development of positively charged poly-L-lysine magnetic nanoparticles as potential MRI contrast agent. Nanomaterials 2023; 13: 1831. doi: 10.3390/nano13121831
Baranovicova E, Racay P, Zubor P, Smolar M, Kudelova E, Halasova E, Dvorska D, Dankova Z.Circulating metabolites in the early stage of breast cancer were not related to cancer stage or subtypes but associated with ki67 level. Promising statistical discrimination from controls. Mol. Cell. Probes 2022; 66: 101862. doi: 10.1016/j.mcp.2022.101862
Baranovicova E, Vnucak M, Granak K, Lehotsky J, Kadasova N, Miklusica J, Dedinska I. Circulating Metabolites in Relation to the Kidney Allograft Function in Posttransplant Patients. Metabolites 2022; 12(7): 661. doi: 10.3390/metabo12070661
Baranovicova E, Kalenska D, Kovalska M, Lehotsky J. Hippocampal metabolic recovery as a manifestation of the protective effect of ischemic preconditioning in rats. Neurochem. Int. 2022; 160: 105419. doi: 10.1016/j.neuint.2022.105419
Baranovicova E, Hnilicova P, Kalenska D, Kaplan P, Kovalska M, Tatarkova Z, Tomascova A, Lehotsky J. Metabolic Changes Induced by Cerebral Ischemia, the Effect of Ischemic Preconditioning, and Hyperhomocysteinemia. Biomolecules 2022; 12(4): 554. doi: 10.3390/biom12040554.
Gombos J, Balejcikova L, Kopcansky P, Batkova M, Siposova K, Kovac J, Zolochevska K, Safarik I, Lokajova A, Garamus VM, Dobrota D, Strbak O. Destruction of lysozyme amyloid fibrils induced by magnetoferritin and reconstructed ferritin. Int. J. Mol. Sci. 2022; 23(22): 13926. doi: 10.3390/ijms232213926
Strbak O, Hnilicova P, Gombos J, Lokajova A, Kopcansky P. Magnetotactic bacteria: from evolution to biomineralization and biomedical applications. Minerals 2022; 12(11): 1403. doi: 10.3390/min12111403
Grayston A, Zhang YJ, Garcia-Gabilondo M, Arrue M, Martin A, Kopcansky P, Timko M, Kovac J, Strbak O, Castellote L, Belloli S, Moresco RM, Picchio M, Roig A, Rosell A. Endovascular administration of magnetized nanocarriers targeting brain delivery after stroke. J. Cereb. Blood Flow Metab. 2022; 42(2): 237-252. doi: 10.1177/0271678X211028816
Baranovicova E, Kalenska D, Grendar M, Lehotsky J.Metabolomic Recovery as a Result of Ischemic Preconditioning Was More Pronounced in Hippocampus than in Cortex That Appeared More Sensitive to Metabolomic Blood Components. Metabolites 2021; 11(8): 516. doi: 10.3390/metabo11080516
Krafcik A, Babinec P, Strbak O, Frollo I. A theoretical analysis of magnetic particle alignment in external magnetic fields affected by viscosity and brownian motion. Appl. Sci. 2021; 11: 9651. doi: 10.3390/app11209651
Strbak O, Balejcikova L, Kmetova M, Gombos J, Kovac J, Dobrota D, Kopcansky P. Longitudinal and transverse relaxivity analysis of native ferritin and magnetoferritin at 7 T MRI. Int. J. Mol. Sci. 2021; 22: 8487. doi: 10.3390/ijms22168487
Baranovicova E, Kalenska D, Tomascova A, Holubcikova S, Lehotsky J.Time-related metabolomics study in the rat plasma after global cerebral ischemia and reperfusion: Effect of ischemic preconditioning. IUBMB Life. 2020; 72(9): 2010-2023. doi: 10.1002/iub.2340
Petras M, Kalenska D, Samos M, Bolek T, Sarlinova M, Racay P, Halasova E, Strbak O, Stasko J, Musak L, Skorvanova M, Baranovicova E. NMR plasma metabolomics study of patients overcoming acute myocardial infarction: in the first 12 h after onset of chest pain with statistical discrimination towards metabolomic biomarkers. Physiol. Res. 2020; 69: 823-834. doi: 10.33549/physiolres.934417
Strbak O, Antal I, Khmara I, Koneracka M, Kubovcikova M, Zavisova V, Molcan M, Jurikova A, Hnilicova P, Gombos J, Kadasova N, Dobrota D. Influence of dextran molecular weight on the physical properties of magnetic nanoparticles for hyperthermia and MRI applications. Nanomaterials 2020; 10: 2468. doi: 10.3390/nano10122468
Hnilicova P, Strbak O, Kolisek M, Kurca E, Zelenak K, Sivak S, Kantorova E. Current methods of magnetic resonance for noninvasive assessment of molecular aspects of pathoetiology in Muliple Sclerosis. Int. J. Mol. Sci. 2020; 21: 6117. doi: 10.3390/ijms21176117
Strbak O, Balejcikova L, Kmetova M, Gombos J, Trancikova A, Pokusa M, Kopcansky P. Quantification of iron release from native ferritin and magnetoferritin induced by vitamins B2 and C. Int. J. Mol. Sci. 2020; 21: 6332. doi: 10.3390/ijms21176332
Antal I, Strbak O, Khmara I, Koneracka M, Kubovcikova M, Zavisova V, Kmetova M, Baranovicova E, and Dobrota D. MRI relaxivity changes of the magnetic nanoparticles induced by different amino acid coatings. Nanomaterials 2020; 10: 394. doi: 10.3390/nano10020394
Výsledkom projektu BioMed Martin, financovaného z EÚ, je prevratné výskumné centrum, ktoré vyvíja nové diagnostické a terapeutické metódy a súčasne posilňuje spoluprácu medzi mestom Martin a Žilinským krajom na Slovensku.